Deze keer zijn zowel Donkey Kong als Diddy Kong door een mysterieuze nieuwe leider van de Kremlings gek-gekidnappt, en het is aan Dixie en zijn nieuwe teamgenoot Kiddy Kong om de dag te redden.
Nieuwe elementen in de serie zijn onder andere de Brother Bears, dertien Beren die, als je ze betaalt met Bear Coins die je in elk level vinden, je helpen in je queeste door bepaalde items te bouwen. Ook speelt je in de nieuwe bonusmissie een 1e/3rd person shooter-stijl partyspel. Plus een heleboel nieuwe vijanden, de gebruikelijke enorme eindbazen en een verzameling van de Kong-familie die je zo goed mogelijk zal helpen.
De Game Boy Advance-versie voegt een nieuwe wereld Pacifica toe, die bestaat uit zes levels en een baaslevel. Ook is er een nieuwe baas genaamd Kroctopuss en een nieuwe Brothers Bear genaamd Bachelor toegevoegd. Swanky’s sideshow.werd omgevormd tot een virtual reality-minigame en Funky Kong biedt ook zijn eigen minigames aan om te spelen. Daarnaast zijn er vijf extra Banana Birds aan het spel toegevoegd, waardoor het totaal op 20 komt.



