Silent Hill 3 is een survival-horrorspel voor één speler. Het verhaal volgt Heather, een tienermeisje dat na een routineus winkelbezoek vast komt te zitten in nachtmerrieachtige, vervormde versies van bekende plekken. Wat begint als een onheilspellende ontmoeting in een winkelcentrum, escaleert al snel in een strijd om te overleven tegen groteske wezens en verschuivende realiteiten. Heathers reis leidt haar naar het in mist gehulde stadje Silent Hill, waar ze het mysterie van haar verleden moet ontrafelen en een sinistere sekte moet confronteren die haar wil gebruiken voor een duister ritueel.
De gameplay combineert verkenning, gevechten en puzzels oplossen in zowel alledaagse als buitenaardse omgevingen. Spelers leiden Heather door gedetailleerde locaties zoals stadsstraten, metrotunnels, ziekenhuizen en verlaten pretparken. Om verder te komen, moeten vaak logische puzzels worden opgelost, sleutels worden gevonden en aanwijzingen worden geïnterpreteerd die verborgen zijn in notities, raadsels en de omgeving zelf. De sfeer speelt een centrale rol. De omgevingen transformeren tussen de ‘normale’ wereld en de roestige, met bloed bevlekte ‘Andere Wereld’.
De gevechten zijn intenser dan in eerdere delen, waardoor Heather toegang heeft tot een breder scala aan wapens. Deze omvatten slagwapens zoals messen, pijpen en strijdhamers, maar ook vuurwapens zoals pistolen, jachtgeweren en machinegeweren. Munitie en genezingsitems zijn beperkt, waardoor zorgvuldig beheer van middelen noodzakelijk is. Heather kan aanvallen blokkeren of ontwijken, hoewel vijanden vaak sterker of talrijker zijn dan zij.
De gebruikersinterface is minimalistisch; de speler pauzeert het spel om toegang te krijgen tot een inventarisscherm met items, wapens en statusinformatie. Opslagpunten zijn verspreid over de omgeving en worden aangegeven met rode symbolen. De moeilijkheidsgraad kan afzonderlijk worden aangepast voor gevechten en puzzels.
Hoewel Silent Hill 3 voortbouwt op de gameplaymechanieken van Silent Hill 2 , legt het de nadruk op een meer lineair verhaal dat nauw verbonden is met de gebeurtenissen van het originele Silent Hill . Tussenfilmpjes stuwen het verhaal voort, met volledig ingesproken dialogen die Heathers interacties met zowel bondgenoten als antagonisten onthullen.



