Gevechten zijn hier het doel van het spel, want de gekke bees, beter bekend als Pokémon, keren terug naar de N64.
Opnieuw heb je de optie om een team van vechtklare krijgers samen te stellen voor een reeks gevechten tegen andere Pokémon-trainers. Onderweg krijg je de kans om te vechten voor een reeks Poké-cups, of neem je je Pokémon mee naar een verzameling minigames voor bonusprijzen (of gewoon voor de lol).
4 spelers kunnen in één toernooi strijden, terwijl de transfer pak je toestaat je Pokémon te uploaden die je hebt uit het assortiment Pokémon Game Boy-spellen (inclusief de originele Pokémon Red en Blue, en de GBC Gold/Silver-serie). Als je de Game Boy-spellen niet hebt, kun je kiezen uit een selectie Pokémon direct uit de doos om zonder te rommelen het gevecht in te gaan.



