Alle personages uit de eerste drie Mortal Kombat-games keren terug voor het ultieme gevecht. Je kunt spelen als Kano, Reptile, Mileena, Kung Lao, Shang Tsung, Sindel, Sektor, Stryker, Nightwolf, Sheeva, Kitana, Scorpion, Sonya, Smoke (Cyber Ninja), Rain, Jade, Baraka, Johnny Cage, Ermac, Noob Saibot, Sub-Zero (Unmasked), Sub-Zero (Classic), Jax, Rayden, Cyrax, Liu Kang, Smoke (mens), Kabal, Goro, Kintaro, Motaro of Shao Kahn.
Dit spel is één-op-één vechtsporten. De speler kan kiezen uit meer dan dertig verschillende personages, elk met hun eigen vechtstijl en speciale moves. Trilogy verschilt van de andere spellen doordat je combinaties van mensen kunt spelen die anders niet mogelijk zijn, zoals oude Liu Kang versus nieuwe Liu Kang, enzovoort.



